Der Begriff "Apokryphen" ist nicht eindeutig - apokryph sind jeweils die Schriften, die mit der Bibel zusammenhängen, aber nicht zu ihr gehören. Für die Katholiken sind die Makkabäerbücher nicht apokryph, sondern Bestandteil der Heiligen Schrift, auf die sich die Theologie stützt. Für die Protestanten eben nicht, sie gehören nicht zu dem, was die Idee "sola scriptura" umfasst.
Einige Bücher, die von den Katholiken ganz regulär als Bestandteil der Heiligen Schrift (also als "Wort Gottes") betrachtet werden, sind für die Protestanten apokryph, z.B. Jesus Sirach oder Judit. Wenn Du also in Deine Lutherbibel reinguckst, dann stehen diese Bücher vielleicht mit drin, aber sie sind nicht Bestandteil der eigentlichen Bibel. Dieses Phänomen gibt es übrigens sowohl im Alten als auch im Neuen Testament. Die unterschiedlichen Konfessionen berufen sich also nicht zwingend auf den selben Textumfang.